на сколько смело можно запускать скрипты, которые писались и отлаживались под питон 2.5 под питоном 2.6 - если все нужные либы на 2.6 есть? есть ли какието тонкости, типа как изменения остатка деления что в версии 3.0 или еще что то - что может незаметно изменить логику программы?

по идее полные изменения происходят только при переходе с 2 на 3к , а так очень мало что меняется .. вообще полный список изменений в версиях описан в дистрибутиве , так же могут быть изменены дополнительные модули которые иногда приходится поднастраивать под 2.6 , а в 2.5 они ставятся автоматом… в остольном проблем возникнуть не должно.