Если это функция, метод или класс, которые возможно заменить целиком своей реализацией, то можно воспользоваться monkey-patching'ом.
Например, есть библиотека requests и в ней нужно заменить Session на свою:
import requests
from requests import Session as OriginalSession
class MySession(OriginalSession):
# ...
requests.Session = requests.sessions.Session = MySession
Возможно, придется заменять в нескольких местах, как в примере выше.